水质毒性分析仪利用一种发光菌进行毒性测定。这种菌发出的光是它呼吸的副产物。当发光菌与水样混合后，样品中的毒性物质会损害发光菌的新陈代谢。发光菌发光强度的减弱与样品中毒性物质的浓度成正比。

　　水质毒性分析仪利用干冻的发光菌和的实验缓冲液来进行自动分析。测定前干冻发光菌需制成水合发光菌悬浮液。

　　水质毒性分析仪的化学原理

　　水质毒性分析仪由经电化学活性微生物氧化的有机物产生的电子将会延着电极进行转移进而引发电。但当有毒物质一同流入时，电化学活性微生物的活性会降低，进而减少产生的电流。可以通过急剧下降的电流值来判断有毒物质的流入与否；当无毒有机物流入时，电化学活性微生物的活性会增加，进而增加产生的电流。可以通过急剧增加的电流值来判断有机物的流入。